一、审计立项由董事会决定，审计组织采用委托投资方内部审计机构的方式。
根据《中外合资经营企业法》及其实施条例的规定，合营企业的组织机构为董事会和经营管理机构，不设立股东会。董事会是合营企业的最高权利机构，决定合营企业的一切重大问题。目前大部分合资企业内部未设立独立的内部审计机构，其内部审计一般由董事会委托外部审计机构对合资企业开展内部审计，通常采取的做法是由董事会委托各股东单位内部审计部门组成联合审计组进行审计。鉴于以上情况，作为投资单位的内部审计监督，在实施审计后对合资企业一般不作审计决定，而只作审计意见书，联合审计组将批准的审计意见书送被审计单位的董事长，并通知本单位派出董事，由董事长召开董事会研究讨论审计建议或意见。
二、审计目的十分明确。合资企业内部审计的目标是明确的，首要就是保护中外投资人的财产安全。
内部审计的任务和职责就是要揭漏和惩罚各种侵犯企业财产的行为。通过内部审计了解经营管理机构在干什么，干得怎么样，是否按投资人的意志决定去经营，是否存在经营者道德风险或逆向选择，导致股东财富受损，自己从中渔利。合资企业董事会通过阅读内部审计报告了解经营管理人员的业绩，以决定经营管理人员的工薪待遇及去留。
三、审前调查阶段应根据合营企业特点收集相关资料。
在审前调查阶段重点要收集的资料应为：合资企业章程、合营各方的出资证明书、审计期间合营企业财务年报及会计师事务所对年报的审计报告、与股东之间的关联方交易类型（特别是与外资股东之间的关联方交易）、公司主要供货商及销售客户、政府批文、税收优惠政策、公司所有银行帐户、公司内部制定的各项规章制度等。
合资企业章程是按照合营企业合同规定的原则，经合营各方一致同意，规定合营企业的宗旨、组织原则和经营管理方法等事项的文件，也是合营企业得以成立的必备法律文件。通过合营企业章程可以了解以下内容：合营企业的宗旨，经营范围和合营期限；合营各方的名称，注册国家，法定地址，法定代表的姓名、职务、国籍；合营企业的投资总额、注册资本、合营各方的出资额、出资比例、出资转让的规定，利润分配和亏损分担的比例；董事会、总经理、副总经理及其他高级管理人员的职责和任免方法；财务、会计、审计制度的原则；财务、会计、审计制度的原则等。
《外商投资企业会计制度》规定合营企业年度报表和清算报表应附有中国注册会计师的查帐报告。这种查账报告主要关注企业的资产、负债、损益的真实性，在制定内部审计方案时应充分参考外部审计成果。
四、审计实施阶段应注意事项。
（一）在审计中，要注意合资企业经营是否按合同、章程的规定贯彻了平等互利的原则，有无一方严重侵犯另一方利益和派出董事违反出资人意愿，侵犯出资利益的事项等，由此类情况，在审计报告中应予充分揭示。这类事项常见的有以下几种形式：
1、国外资本出资不实。对合资企业成立初期应将出资情况如合资各方出资是否及时、足额到位，出资的设备是构作价过高，出资的技术是否先进、适用等作为审计的重点，以保证合资企业实收资本
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