[摘要]虽然在西藏高原地区有着大量的乙肝表面杭原阳性的群体,但是目前还未见报道来自这一地区的乙肝病毒(HBV)的DNA序列。因此我们将对26例乙肝表面杭原阳性的藏民血清中分离到的乙肝病毒进行定性研究。为了确定HBV的基因型及它的多基因联系,我们对两个基因部位进行了测序,其中一个包括preSl/preS2/S部位,另一个包括preC/C部位,并基于所处部位的不同而分为两种不同的基因型。为了更明确这一发现,我们又对代表不同组别的HBV基因组进行了测序,结果表明存在于西藏的HBV属于C基因型,而在C基因型中至少存在两种亚群,一为占多数的亚群为C/D杂交型,其血清型为ayw,另一为C基因型,其血清型为adw。本文首次报道来自西藏的HBV的全部核普酸序列,这一结果将有助于全球的关于重组HBV的研究,并促进来自这一地区的HBV的基因型及基因重组的探索。
引言:
虽然在世界的80多个国家已经加强了使用乙肝表面抗原疫苗及众多的免疫措施,HBV感染仍是一个主要危害公众健康的问题。目前在全世界范围内有约3亿5千万慢性携带者,其中约10%可能死于继发的肝硬化和肝细胞癌(Kane,1996)。过去20年的分子流行病学研究将HBVDNA序列分为7种基因型,A-G(Okamoto et al.,1986;Norder et al.,1992;Norder et al., 1994;Stuyver et al.,2000)。HBV基因型的界定是基于以下定义:组别之间的全部基因组核昔酸序列的差别不低于8%,或表面基因的差别不低于4.1%(Okamoto et al.,1988;Norder et al.,1994;)。基因组的分布也表现出地理位置的特点,基因型A广泛分布于世界范围;基因型B和C主要见于亚洲;基因型D在欧洲南部、美洲和澳洲;基因型E主要见于非洲;基因型F发现于印地安人和玻利维亚人,而基因型G则主要在美国和欧洲(Stuyver et al.,2001)。在中国流行的HBV主要是基因型B和C(Zhu et al.,1999)。此外也观察到重组的基因型。多基因分析表明B/C重组体广泛存在于亚洲东部,A/ D重组体存在于意大利(Morozov et al.,2000)。
在西藏,有26.2%的人群为乙肝表面抗原阳性(Luo et al.,1993)。但是目前未见关于HBV的研究报道。未发现的基因型有可能在HBV的高感染率中起着重要的作用。通过对来自这一地区的HBV进行测序及多基因分析,我们发现西藏的主要的HBV基因型为C/D杂交型。
材料与方法:
研究对象:1000多份乙肝表面抗原阳性的血清样本,采自西藏自治区的主要城市(拉萨、日喀则、山南、那曲)无临床症状的HBV感染的中学生。这些学生均未观察到肝功能异常。所有的研究对象均为西藏人。26例样本乃随机抽取。在这26例分析样本的平均年龄为14.8岁。
HBVDNA的提纯和扩增:血清样本在-80(C中储存待测。病毒DNA提取自50(1含NP-40和0.75%的Tween-20的血清裂解液。对应于裂解基因组包括preC/C基因的1746nt到2502nt(片段A)及包括presl/preS2/S基因的2798nt到861nt的两个片段(片段B)进行PCR。片段A使用引物CH和CR1进行扩增,再用引物CF2和CR1进行半巢式反应。两种HBV的全部基因组使用表1中所列的引物进行扩增。扩增过程为
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